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聖嬰現象在全球各地造成的影響並不相同，某些國家可能會因為降雨量過多，而造成水災，某些地區可能會因為缺水而有乾旱發生。
中興大學經濟系教授陳吉仲指出，水資源供給不穩定，將嚴重影響經濟發展；
以台灣為例，今年是反聖嬰年，中北部地區1至3月的降雨量可能會減少。
運用科技可以事先準確預測聖嬰現象，對於政策執行有很大的幫助。

陳吉仲：『聖嬰現象主要是對水資源、農業漁業還有傳染疾病有影響，這樣的氣候已經可以被人類準確預測，如果知道反聖嬰年對北中部春天雨量偏少，實際上可以在第一期農民種植水稻前，先休耕停灌，把水資源由農業部門移轉到工業跟民生部門，工業跟農業都會同時獲取效益。』

陳吉仲指出，反聖嬰年將迫使台灣中、北部地區農地收成不如以往，是否可藉由推動農地復耕，藉以增加糧食產量？
陳吉仲：『如果休耕20幾萬公頃農地復耕，最重要考慮要素供給，水資源跟肥料，肥料其實供給不太夠，
因為反聖嬰年北中部降雨量會減少，但南部如果不會(受到影響)其實可以考慮復耕。』

陳吉仲表示，如果事先能做好聖嬰現象對水資源市場的損失預估，政府不只可以及早調整因應策略，也能降低氣候劇變對經濟所造成的影響。